点球决战中，诺伊尔扑出马塔点球，但切赫扑出奥利奇和施魏因斯泰格点球，拜仁5次欧战点球首次告负，第3次输掉冠军联赛决赛，追平AC米兰和尤文图斯 拜仁巴德斯图伯阿拉巴古斯塔沃停赛，季莫舒克客串中卫，孔滕托打左后卫，克罗斯撤到后腰位置，由穆勒打前腰罗本出战老东家切尔西则有队长特里和伊万诺维奇拉米雷斯梅雷莱斯停赛，卡希尔和路易斯及。
转出布拉夫海德 ，霍芬海姆，转会德米凯利斯 ，马拉加，转会范博梅尔 ，AC米兰，自由转会阿拉巴 ，霍芬海姆，租借 沙尔克04 转入卡里米 ，阿津钢铁，租借查里斯特亚斯 ，法甲阿维尼翁，自由转会阿韦拉尔 ，乌克兰喀尔巴阡山利沃夫，租借雷伊纽森 ， ，结束租借安南 ，罗森博格，转会 转出。
欧洲赛场上，继捧得联盟杯后，199495赛季冠军杯当中阿贾克斯的表现也尤其出色，半决赛当中力克拜仁，小组赛和决赛三度击败AC米兰且一球未丢，把当时由卡佩罗不过，总的来说范加尔在拜仁的执教历程还是可圈可点的，尤其是将施魏因斯泰格移到后腰位置的战术变化和大力提拔托马斯穆勒巴德斯图贝尔和阿拉巴等年轻球员的。
在拜仁，克罗斯成为19岁以下青年队一名极富创造力的进攻核心，并帮助球队打入2007年德国19岁以下联赛决赛，但加时赛最终以12不敌勒沃库森由于表现持续良好，克罗斯以17岁7个月零18天的年龄，创造了当时拜仁慕尼黑最年轻的球员联赛出场纪录，该记录在2010年被阿拉巴打破那场比赛中他两次助攻克洛泽，帮助拜仁完成了。